Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms