Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms