Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6P435 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6P435 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6P435 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6P435 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6P435 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6P435 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6P435 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6P435 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6P435 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6P435 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6P435 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6P435 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6P435 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6P435 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6P435 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6P435 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6P435 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6P435 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6P435 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6P435 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6P435 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6P435 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6P435 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6P435 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6P435 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6P435 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6P435 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6P435 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6P435 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6P435 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6P435 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6P435 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6P435 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6P435 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6P435 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms