Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF544Q6NX49 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms