Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms