Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms