Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms