Protein–RNA interactions for Protein: Q5TA50

CPTP, Ceramide-1-phosphate transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPTPQ5TA50 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPTPQ5TA50 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms