Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms