Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP2LQ5T4T6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP2LQ5T4T6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP2LQ5T4T6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP2LQ5T4T6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP2LQ5T4T6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP2LQ5T4T6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYCP2LQ5T4T6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYCP2LQ5T4T6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYCP2LQ5T4T6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYCP2LQ5T4T6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYCP2LQ5T4T6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYCP2LQ5T4T6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYCP2LQ5T4T6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYCP2LQ5T4T6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYCP2LQ5T4T6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYCP2LQ5T4T6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYCP2LQ5T4T6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYCP2LQ5T4T6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYCP2LQ5T4T6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP2LQ5T4T6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms