Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms