Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms