Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms