Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms