Protein–RNA interactions for Protein: Q52MB2

CCDC184, Coiled-coil domain-containing protein 184, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC184Q52MB2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC184Q52MB2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC184Q52MB2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms