Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms