Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms