Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LTC4SQ16873 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms