Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms