Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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