Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms