Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SSX1Q16384 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SSX1Q16384 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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