Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA4Q16363 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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