Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms