Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1EQ15878 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms