Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms