Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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