Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms