Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TLR1Q15399 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms