Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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