Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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