Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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COL19A1Q14993 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL19A1Q14993 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL19A1Q14993 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL19A1Q14993 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL19A1Q14993 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL19A1Q14993 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL19A1Q14993 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL19A1Q14993 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL19A1Q14993 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL19A1Q14993 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL19A1Q14993 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL19A1Q14993 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
COL19A1Q14993 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
COL19A1Q14993 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL19A1Q14993 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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COL19A1Q14993 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
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