Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms