Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms