Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms