Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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SNTB1Q13884 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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