Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
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DDX39BQ13838 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
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DDX39BQ13838 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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DDX39BQ13838 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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DDX39BQ13838 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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DDX39BQ13838 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
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