Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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TUBA3CQ13748 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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TUBA3CQ13748 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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TUBA3CQ13748 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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TUBA3CQ13748 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
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