Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
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