Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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