Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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FOXE3Q13461 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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FOXE3Q13461 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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FOXE3Q13461 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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FOXE3Q13461 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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FOXE3Q13461 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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FOXE3Q13461 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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FOXE3Q13461 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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