Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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