Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIGQ13278 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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