Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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NR1H3Q13133 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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NR1H3Q13133 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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NR1H3Q13133 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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NR1H3Q13133 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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NR1H3Q13133 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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NR1H3Q13133 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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NR1H3Q13133 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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NR1H3Q13133 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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NR1H3Q13133 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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NR1H3Q13133 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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