Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
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