Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms