Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWF1Q12792 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWF1Q12792 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWF1Q12792 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWF1Q12792 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWF1Q12792 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWF1Q12792 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TWF1Q12792 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TWF1Q12792 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TWF1Q12792 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TWF1Q12792 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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