Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL1Q08397 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL1Q08397 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL1Q08397 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL1Q08397 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL1Q08397 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL1Q08397 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LOXL1Q08397 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL1Q08397 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL1Q08397 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL1Q08397 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL1Q08397 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL1Q08397 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL1Q08397 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL1Q08397 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LOXL1Q08397 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LOXL1Q08397 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LOXL1Q08397 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LOXL1Q08397 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms