Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms