Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RELAQ04206 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RELAQ04206 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RELAQ04206 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RELAQ04206 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RELAQ04206 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RELAQ04206 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RELAQ04206 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RELAQ04206 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RELAQ04206 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RELAQ04206 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RELAQ04206 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RELAQ04206 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RELAQ04206 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RELAQ04206 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RELAQ04206 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RELAQ04206 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RELAQ04206 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RELAQ04206 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RELAQ04206 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RELAQ04206 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RELAQ04206 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RELAQ04206 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RELAQ04206 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RELAQ04206 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RELAQ04206 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RELAQ04206 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RELAQ04206 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RELAQ04206 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RELAQ04206 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RELAQ04206 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RELAQ04206 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RELAQ04206 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RELAQ04206 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RELAQ04206 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RELAQ04206 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RELAQ04206 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RELAQ04206 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RELAQ04206 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RELAQ04206 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RELAQ04206 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RELAQ04206 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RELAQ04206 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RELAQ04206 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RELAQ04206 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RELAQ04206 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RELAQ04206 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RELAQ04206 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RELAQ04206 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RELAQ04206 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RELAQ04206 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RELAQ04206 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RELAQ04206 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RELAQ04206 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RELAQ04206 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RELAQ04206 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RELAQ04206 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RELAQ04206 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RELAQ04206 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RELAQ04206 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RELAQ04206 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RELAQ04206 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RELAQ04206 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RELAQ04206 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RELAQ04206 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RELAQ04206 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RELAQ04206 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RELAQ04206 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RELAQ04206 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RELAQ04206 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RELAQ04206 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RELAQ04206 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RELAQ04206 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RELAQ04206 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RELAQ04206 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RELAQ04206 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RELAQ04206 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RELAQ04206 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RELAQ04206 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RELAQ04206 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RELAQ04206 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RELAQ04206 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RELAQ04206 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RELAQ04206 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RELAQ04206 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RELAQ04206 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RELAQ04206 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RELAQ04206 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RELAQ04206 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RELAQ04206 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RELAQ04206 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RELAQ04206 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RELAQ04206 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RELAQ04206 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RELAQ04206 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RELAQ04206 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RELAQ04206 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RELAQ04206 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RELAQ04206 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RELAQ04206 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms